Главная страница
russian   english
16+
<< назад

Название статьи

ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПОЛНОЙ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ОТКРЫТОЙ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ГЕНА КАПСИДНОГО БЕЛКА VP7 РОТАВИРУСОВ ГРУППЫ А И ЕЕ АНАЛИЗ


Номер журнала
2
Дата выпуска
2012

Тип статьи
научная статья
Коды УДК
577
Страницы
79-84
Ключевые слова
ротавирусы, полимеразная цепная реакция, праймер, нуклеотидная последовательность, генотип G1P[8], белок VP7, сублиния

Авторы
Сашина Татьяна Александровна
Морозова Ольга Владимировна
Фомина Светлана Григорьевна
Епифанова Наталья Владимировна
Новикова Надежда Алексеевна

Место работы
Сашина Татьяна Александровна
Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. И.Н. Блохиной; Нижегородский госуниверситет им. Н.И. Лобачевского

Морозова Ольга Владимировна
Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. И.Н. Блохиной

Фомина Светлана Григорьевна
Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. И.Н. Блохиной

Епифанова Наталья Владимировна
Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. И.Н. Блохиной

Новикова Надежда Алексеевна
Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. И.Н. Блохиной; Нижегородский госуниверситет им. Н.И. Лобачевского


Аннотация
Разработан метод амплификации перекрывающихся фрагментов 9-го гена ротавирусов группы А для определения полной нуклеотидной последовательности ОРС гена капсидного белка VP7. Филогенетический анализ нуклеотидной последовательности гена VP7 позволил отнести нижегородские изоляты ротавируса к сублинии G1-II-Е.

Загрузить статью

Библиографический список
1 . Hyser J.M., Estes M.K. Rotavirus vaccines and pathogenesis: 2008 // Curr. Opin. Gastroenterol. 2009. V. 25. P. 36–43.
2 . Gray J., Vesikari T., Van Damme P. et al. Rotavirus // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2008. V. 46. P. 24–31.
3 . http://rotac.regatools.be/classificationinfo.html (дата обращения: 03.04.2012)
4 . Arista S., Giammanco G.M., De Grazia S. et al. Heterogeneity and temporal dynamics of evolution of G1 human rotaviruses in a settled population // J. Virol. 2006. V. 80. P. 10724–10733.
5 . Phan T.G., Khamrin P., Quang T.D. et al. Detection and genetic characterization of group A rotavirus strains circulating among children with acute gastroenteritis in Japan // J. Virol. 2007. V. 81. P. 4645–4653.
6 . Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum Parsimony methods // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. P. 2731–2739.
7 . Бессараб И.Н., Новикова Н.А., Бородин А.М. Использование полимеразной цепной реакции для анализа ротавирусов. Нуклеотидная последовательность гена, кодирующего основной нейтрализующий антиген VP7 ротавируса человека нового G-серотипа // Биоорганическая химия. 1990. Т. 16. № 12. С. 1689–1692.