ОПРЕДЕЛЕНИЕ ПОЛНОЙ НУКЛЕОТИДНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ОТКРЫТОЙ РАМКИ СЧИТЫВАНИЯ ГЕНА КАПСИДНОГО БЕЛКА VP7 РОТАВИРУСОВ ГРУППЫ А И ЕЕ АНАЛИЗ |
2 | |
2012 |
научная статья | 577 | ||
79-84 | ротавирусы, полимеразная цепная реакция, праймер, нуклеотидная последовательность, генотип G1P[8], белок VP7, сублиния |
Разработан метод амплификации перекрывающихся фрагментов 9-го гена ротавирусов группы А для определения полной нуклеотидной последовательности ОРС гена капсидного белка VP7. Филогенетический анализ нуклеотидной последовательности гена VP7 позволил отнести нижегородские изоляты ротавируса к сублинии G1-II-Е. |
![]() |
1 . Hyser J.M., Estes M.K. Rotavirus vaccines and pathogenesis: 2008 // Curr. Opin. Gastroenterol. 2009. V. 25. P. 36–43. 2 . Gray J., Vesikari T., Van Damme P. et al. Rotavirus // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2008. V. 46. P. 24–31. 3 . http://rotac.regatools.be/classificationinfo.html (дата обращения: 03.04.2012) 4 . Arista S., Giammanco G.M., De Grazia S. et al. Heterogeneity and temporal dynamics of evolution of G1 human rotaviruses in a settled population // J. Virol. 2006. V. 80. P. 10724–10733. 5 . Phan T.G., Khamrin P., Quang T.D. et al. Detection and genetic characterization of group A rotavirus strains circulating among children with acute gastroenteritis in Japan // J. Virol. 2007. V. 81. P. 4645–4653. 6 . Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum Parsimony methods // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28. P. 2731–2739. 7 . Бессараб И.Н., Новикова Н.А., Бородин А.М. Использование полимеразной цепной реакции для анализа ротавирусов. Нуклеотидная последовательность гена, кодирующего основной нейтрализующий антиген VP7 ротавируса человека нового G-серотипа // Биоорганическая химия. 1990. Т. 16. № 12. С. 1689–1692. |