Главная страница
russian   english
16+
<< назад

Название статьи

МОДЕЛИРОВАНИЕ РАСТЯЖЕНИЯ МОЛЕКУЛЫ ДНК В РАМКАХ КРУПНОЗЕРНИСТОЙ МОДЕЛИ


Номер журнала
4
Дата выпуска
2011

Тип статьи
научная статья
Коды УДК
547.963.32:541.64
Страницы
454-456
Ключевые слова
ДНК, растяжение, отдельная молекула, крупнозернистые модели, механические свойства, компьютерное моделирование

Авторы
Кикоть Ирина Павловна
Савин Александр Васильевич

Место работы
Кикоть Ирина Павловна
Институт химической физики им. Н.Н. Семенова РАН, Москва

Савин Александр Васильевич
Институт химической физики им. Н.Н. Семенова РАН, Москва


Аннотация
Механические свойства молекулы ДНК, такие как продольная и изгибная жесткости, влияют на то, как молекула взаимодействует с различными белками, а также на ее поведение внутри наноустройств. За последние десять лет проводилось много экспериментов, посвященных растяжению одиночной молеку- лы ДНК с помощью атомно-силовой микроскопии и других методов. Результаты экспериментов свиде- тельствуют о том, что поведение молекулы ДНК при растяжении полностью не описывается известными механическими моделями полимеров (такими, как растяжимая персистентная модель), а природа растя- нутого состояния до сих пор является предметом дискуссии. В настоящем исследовании растяжение одиночной молекулы ДНК моделируется в рамках разработанной крупнозернистой модели. Результаты расчетов дают основания полагать, что при продольной нагрузке растяжение молекулы происходит не- равномерно и длина молекулы увеличивается за счет увеличения доли сильно растянутых звеньев. Таким образом, растянутое состояние ДНК представляет собой не две отдельные нити, как предполагается в некоторых работах, а двуспиральную молекулу, в которой присутствуют сильно и слабо растянутые звенья.

Загрузить статью

Библиографический список
1 . Cluzel P. et al. // Science. 1996. V. 271. P. 792?794.
2 . Smith S.B. et al. // Science. 1996. V. 271. P. 795?799.
3 . Rouzina I., Bloomfield V. // Biophys. J. 2001. V. 80. P. 882?893.
4 . Fu H. et al. // Nucleic Acids Research. 2010. V. 80. P. 1?7.
5 . Зубова Е.А. и др. // Структура и динамика молекулярных систем: Сб. статей XVI Всерос. конф. Яльчик. 2009. Ч. 3. C. 19?24.